Module also offered within study programmes:
General information:
Name:
Geomicrobiology
Course of study:
2015/2016
Code:
BGG-2-206-MS-s
Faculty of:
Geology, Geophysics and Environmental Protection
Study level:
Second-cycle studies
Specialty:
Applied Mineralogy and Gemmology
Field of study:
Mining and Geology
Semester:
2
Profile of education:
Academic (A)
Lecture language:
English
Form and type of study:
Full-time studies
Course homepage:
 
Responsible teacher:
dr hab. inż. Manecki Maciej (gpmmanec@cyf-kr.edu.pl)
Academic teachers:
dr hab. inż. Manecki Maciej (gpmmanec@cyf-kr.edu.pl)
Module summary

Description of learning outcomes for module
MLO code Student after module completion has the knowledge/ knows how to/is able to Connections with FLO Method of learning outcomes verification (form of completion)
Knowledge
M_W001 Ma podstawową wiedzę w zakresie klasyfikacji, budowy i procesów metabolicznych mikroorganizmów. GG2A_W05, GG2A_U01, GG2A_U06 Test
M_W002 Posiada wiedzę w zakresie zastosowania wybranych gatunków bakterii w procesach technologicznych ze szczególnym uwzględnieniem gałęzi ochrony środowiska i gospodarki metalami. GG2A_U05, GG2A_W06, GG2A_U01, GG2A_U06, GG2A_K02 Test
M_W003 Umie scharakteryzować rolę mikroorganizmów w procesach mineralogicznych, geochemicznych i geologicznych. GG2A_U06, GG2A_U19, GG2A_W08 Test
M_W004 Zna podstawowe metody badawcze oraz budowę i działanie instrumentów analitycznych stosowanych w geomikrobiologii. GG2A_U15, GG2A_W06, GG2A_W11, GG2A_U06, GG2A_U19, GG2A_U14, GG2A_W02 Test
M_W005 Rozumie i potrafi opisać budowę, życie i przydatność wybranych gatunków mikroorganizmów. GG2A_U05, GG2A_U06, GG2A_U02, GG2A_U04 Test
M_W006 Student ma wiedzę dotyczącą nowoczesnych metod modyfikacji genetycznej bakterii, w szczególności w kontekście ryzyka, etyki i zastosowania tego typu działań badawczych GG2A_K03, GG2A_U01, GG2A_U19, GG2A_U02 Test
FLO matrix in relation to forms of classes
MLO code Student after module completion has the knowledge/ knows how to/is able to Form of classes
Lecture
Audit. classes
Lab. classes
Project classes
Conv. seminar
Seminar classes
Pract. classes
Zaj. terenowe
Zaj. warsztatowe
Others
E-learning
Knowledge
M_W001 Ma podstawową wiedzę w zakresie klasyfikacji, budowy i procesów metabolicznych mikroorganizmów. + - - - - - - - - - -
M_W002 Posiada wiedzę w zakresie zastosowania wybranych gatunków bakterii w procesach technologicznych ze szczególnym uwzględnieniem gałęzi ochrony środowiska i gospodarki metalami. + - - - - - - - - - -
M_W003 Umie scharakteryzować rolę mikroorganizmów w procesach mineralogicznych, geochemicznych i geologicznych. + - - - - - - - - - -
M_W004 Zna podstawowe metody badawcze oraz budowę i działanie instrumentów analitycznych stosowanych w geomikrobiologii. - - - - - - - - - - -
M_W005 Rozumie i potrafi opisać budowę, życie i przydatność wybranych gatunków mikroorganizmów. + - - - - - - - - - -
M_W006 Student ma wiedzę dotyczącą nowoczesnych metod modyfikacji genetycznej bakterii, w szczególności w kontekście ryzyka, etyki i zastosowania tego typu działań badawczych + - - - - - - - - - -
Module content
Lectures:

1. How the microorganisms are classified, the physical constrains governing their growth, molecular approaches to microbial diversity (2 h.)
2. Life in extreme environments (2 h.)
3. Microbial metabolism: selected functions, capabilities and major biogeochemical pathways (2 h.)
4. Chemical reactivity of the cell surface and sorption of metals. (1)
5. Biomineralization and bacteria-mediated formation of minerals (2 h.)
6. Mineral dissolution and oxidation in the presence of bacteria, industrial and environmental ramifications of thee processes (3 h.)
7. The role of bacteria in the hydrometallurgy, contaminant mobility and bioremediation/biorecovery (2 h.)
8. The genetically altered bacteria – methods, application, hazard and ethics (2 h.)
9. The geomicrobiology in a laboratory – experimental methods and facilities (5 h.)
10. How can I help you? The microbe of the week – selected bacterial strains and their capabilities (5 h.)
11. The biofilm formation and its role in mineralogical process (2 h.)
12. Synergic effects of geological and biological processes that led to the emergence of life, evolution of metabolic processes, and diversification of the biosphere and geosphere (2 h.)

Student workload (ECTS credits balance)
Student activity form Student workload
Summary student workload 75 h
Module ECTS credits 3 ECTS
Participation in lectures 30 h
Realization of independently performed tasks 35 h
Preparation for classes 10 h
Additional information
Method of calculating the final grade:

Ocena końcowa = ocena z kolokwium

Prerequisites and additional requirements:

Znajomość mineralogii, geochemii, j. angielskiego

Recommended literature and teaching resources:

1. Kurt Konhauser (2007) Introduction to Geomicrobiology
2. Władysław J.H. Kunicki – Goldfinger (1996) Życie bakterii
3. Anhuai Lu and Hailiang Dong (2012) Elements: Minerals, Microbes and Remediation, Vol 8/2

Scientific publications of module course instructors related to the topic of the module:

Additional scientific publications not specified

Additional information:

None